A homológia modellezés egy célfehérje háromdimenziós szerkezetét kapja meg a templát és a célszekvenciák közötti hasonlóság alapján, és ez a technika hatékonynak bizonyult olyan membránfehérjék tanulmányozása során, amelyek nehéz kristályosítani, mint a GPCR, mivel jobb megértést tesz lehetővé …
Mi az a homológiamodellezés, és miért van rá szükség?
1.2.
A homológia modellezés a legpontosabb számítási módszer megbízható szerkezeti modellek létrehozására, és számos biológiai alkalmazásban gyakran használják. A homológia modellezés előrejelzi a lekérdező fehérje 3D szerkezetét a templátfehérjék szekvencia-illesztésén keresztül.
Mi a homológia modellezés elve?
A homológia modellezést összehasonlító modellezésnek is nevezik, amely előrejelzi a fehérjeszerkezeteket az ismert szerkezetekkel való szekvenciahomológia alapján. Azon az elven alapul, hogy „ ha két fehérje szekvenciája elég nagy hasonlóságot mutat, valószínűleg nagyon hasonló háromdimenziós szerkezettel rendelkeznek.”
Mitől jó a homológia modellezés?
Ha egy "nagyon sikeres homológiamodellt" úgy határozunk meg, hogy az empirikus struktúrából <=2 Å rmsd, akkor a sablonnak >=60%-os szekvenciaazonossággal kell rendelkeznie a céllal a sikerhez arány >70% Még magas szekvenciaazonosságok (60%-95%) esetén is tízből egy homológiamodell rmsd >5 Å vs.
Az alábbiak közül melyik igaz a homológiamodellezésre?
Magyarázat: Ahogy a neve is sugallja, a homológiamodellezés megjósolja a fehérjeszerkezeteket az ismert szerkezetekkel való szekvenciahomológia alapján A homológiamodellezés minden atomot tartalmazó modellt hoz létre, amely a templátfehérjékhez való igazodáson alapul.… Az igazítási lépésben elkövetett hibák nem javíthatók a következő modellezési lépésekben.
