A metagenomikát úgy definiálják, mint környezeti mintával tartalmazott genomok közvetlen genetikai elemzését A terület kezdetben a környezeti DNS klónozásával kezdődött, majd a funkcionális expressziós szűréssel [1], majd gyorsan kiegészítették a környezeti DNS közvetlen véletlenszerű sörétes szekvenálásával [2, 3].
Mi a metagenomika folyamata?
Metagenomika magában foglalja a DNS kinyerését egy közösségen belüli összes mikroorganizmusból, anélkül, hogy szükségszerűen azonosítanánk az összes érintett fajt. A gének szekvenálása és azonosított szekvenciákkal való összehasonlítása után meg lehet határozni e gének funkcióit.
Milyen technikát használnak a metagenomikában?
A mikrobiális közösség mintáját tengervízből, üledékből, gazdaállatból vagy más tengeri élőhelyből gyűjtik. Az összegyűjtött sejteket ezután lizálják, és a DNS-t kivonják lizátumukból. A metagenomikát lehetővé tevő technika a shotgun szekvenálás, amely véletlenszerű DNS-régiókat szekvenál meg nem célzott módon.
Mi a metagenomikai tanulmányozás 3 lépése?
A metagenomika lépései és folyamata:
- Mintagyűjtemény:
- DNS-kinyerés:
- Mintaelőkészítés:
- Mintaelemzés:
Hogyan történik a funkcionális metagenomika?
A funkcionális metagenomika magában foglalja DNS izolálását a mikrobiális közösségekből, hogy tanulmányozzák a kódolt fehérjék funkcióit. Ez magában foglalja a DNS-fragmensek klónozását, a gének expresszálását egy helyettesítő gazdaszervezetben, valamint az enzimaktivitások szűrését.
