A
BigWig egy fájlformátum sűrű, folytonos adatok megjelenítésére egy genomböngésző sávban, amelyet Wiggle (WIG) formátumból való konvertálással hoztak létre. A BigWig formátum leírása az UCSC Genome Bioinformatics webhelyén található, a Broad Institute fájlformátum-útmutató pedig további információkkal szolgál.
Mi az a bigWig formátum?
A bigWig formátum sűrű, folytonos adatok megjelenítésére szolgál, amelyek grafikonként jelennek meg A BigWig fájlok kezdetben WIG típusú fájlokból jönnek létre, a wigToBigWig UCSC program segítségével. Alternatív megoldásként bigWig fájlok is létrehozhatók bedGraph fájlokból a UCSC bedGraphToBigWig program segítségével.
Hogyan használhatom a bigWig fájlt?
Az újonnan létrehozott bigWig fájl áthelyezése (myBigWig.bw) egy interneten elérhető http, https vagy ftp helyre. Illessze be az URL-t az egyéni sávbeviteli űrlapba, vagy készítsen egyéni sávot egyetlen nyomvonal használatával. Illessze be az egyéni nyomvonalat az egyéni nyomvonalkezelési oldalon lévő szövegmezőbe.
Mi az a bigWig szám?
A
bigWig Tracks sávok a folyamatos jelekhez a teljes genomban. Alkalmasak különféle „nyers” kísérleti eredmények, például ChIP-Seq jelek, RNA-Seq jelek stb. megjelenítésére.
Hogyan hozhatok létre bigWig fájlt?
Többféleképpen hozhat létre nagyméretű fájlokat. Ez általában egy. bam fájlt mozgatási sávvá (. wig), majd a mozgatási sávot bináris bigwig formátummá alakítja (.
