SDS erősen kötődik a fehérjék pozitív töltésű és hidrofób maradékaihoz szulfátcsoportjain és alkilláncain keresztül 13 Ennek megfelelően, értékes mosószer a szerkezetbiológia és a fehérje feltekeredési/feltekeredési vizsgálatok területén.
Mit tesz az SDS a fehérjével?
Az SDS egy amfipatikus felületaktív anyag. denaturálja a fehérjéket azáltal, hogy a fehérjelánchoz kötődik szénhidrogén-farkával, feltárja a normálisan eltemetett régiókat, és bevonja a fehérjeláncot felületaktív molekulákkal. Az SDS poláris fejcsoportja további előnyt jelent ennek a denaturálószernek a használatához.
Hogyan kötődik az SDS az aminosavakhoz?
Az SDS hidrofób farokkal rendelkezik, amely erős kölcsönhatásba lép a fehérje (polipeptid) láncokkal. A fehérjékhez kötődő SDS-molekulák száma arányos a fehérjét alkotó aminosavak számával Minden SDS-molekula két negatív töltéssel jár, amelyek felülmúlják a fehérje esetleges töltését.
Az SDS bevonja a fehérjéket?
Az
SDS egyenletes negatív töltéssel vonja be a fehérjét, amely elfedi az R-csoportok belső töltéseit. Az SDS meglehetősen egyenletesen kötődik a lineáris fehérjékhez (körülbelül 1,4 g SDS/1 g fehérje), ami azt jelenti, hogy a fehérje töltése megközelítőleg arányos a molekulatömegével.
Hogyan ad az SDS negatív töltést a fehérjének?
Az SDS egy hosszú alifás láncot és egy szulfátcsoportot tartalmazó mosószer. Ez a mosószer kölcsönhatásba lép denaturált fehérjékkel , és erősen negatív töltésű komplexet képez (a negatív töltés a SO42 − SDS csoport). A fehérjéket először hővel denaturálják, majd nagy feleslegben hozzáadják az SDS-t.