Műveleti taxonómiai egység vagy OTU tekinthető a numerikus taxonómiában használt alapegységnek. Ezek az egységek egyedre, fajra, nemzetségre vagy osztályra vonatkozhatnak. A numerikus módszerekben a használt taxonómiai egységek állandóan nem hasonlíthatók össze a formális taxonómiai egységekkel.
Hogyan történik a numerikus taxonómia szerinti osztályozás?
A numerikus taxonómia egy osztályozási rendszer a biológiai szisztematikában, amely a taxonómiai egységek karakterállapotuk alapján történő numerikus módszerekkel történő csoportosításával foglalkozik Célja taxonómia létrehozása olyan numerikus algoritmusok segítségével, mint pl. klaszterelemzés, nem pedig tulajdonságaik szubjektív értékelése.
Mik azok az OTU-k a botanikában?
Operational Taxonomic Unit (OTU) Ugyanazon a fajon belül létezik egy genetikai diverzitás (a nukleotidszekvenciák szerint). Az OTU ugyanazon fajhoz tartozó egyedek csoportja, amelyek 16S rRNS szekvenciái 97,5%-os hasonlóságot mutatnak.
Mi a numerikus taxonómia alapegysége?
Műveleti taxonómiai egység a numerikus taxonómia alapegysége. Lehet egy egyed, faj, nemzetség, család, rend vagy osztály.
Milyen gént használnak általában a bakteriális OTU-k meghatározására?
Az operatív taxonómiai egységek (OTU-k) fogalma, amely "matematikailag" meghatározott taxonokat hoz létre, széles körben elfogadott és alkalmazott baktériumközösségek leírására a 16S rRNS gén amplikon szekvenálásával.