A
BLAST egy számítógépes algoritmus, amely online használatra elérhető a National Center for Biotechnology Information (NCBI) webhelyén, valamint sok más webhelyen. A BLAST gyorsan össze tud igazítani és összehasonlítani egy lekérdezett DNS-szekvenciát egy szekvencia-adatbázissal, ami a folyamatban lévő genomikai kutatások kritikus eszközévé teszi.
A BLAST elsődleges adatbázis?
A
BLAST a legszélesebb körben használt szoftver a bioinformatikai kutatásban. Fő funkciója egy érdekes sorozat, a lekérdezési szekvencia összehasonlítása egy nagy adatbázisban BLAST, majd jelenti az adatbázisban talált legjobb egyezéseket vagy „találatokat”. Ennek az egyszerű programnak két elsődleges alkalmazása van.
Az NCBI egy adatbázis?
Az NCBI egy sor biotechnológiával és biomedicinával kapcsolatos adatbázist tartalmaz, és a bioinformatikai eszközök és szolgáltatások fontos forrása. A főbb adatbázisok közé tartozik a GenBank a DNS-szekvenciákhoz és a PubMed, az orvosbiológiai irodalom bibliográfiai adatbázisa. Egyéb adatbázisok közé tartozik az NCBI Epigenomics adatbázis.
A BLAST csak az NCBI adatbázisokban használatos?
A
BLAST elérhető az interneten az NCBI webhelyén. A lekérdezési szekvenciáktól és a céladatbázisoktól függően különböző típusú BLAST-ok állnak rendelkezésre.
Hogyan működik a BLAST adatbázis?
Hogyan működik a BLAST? BLAST azonosítja a homológ szekvenciákat egy heurisztikus módszerrel, amely kezdetben rövid egyezéseket talál két szekvencia között; így a módszer nem veszi figyelembe a teljes sorozatteret. A kezdeti egyezés után a BLAST megpróbálja elindítani a helyi igazításokat ezekből a kezdeti egyezésekből.
